Le Flûteau nageant est une petite plante aquatique des eaux calmes et peu profondes. Rare à l’échelle mondiale, elle est protégée en France et fait l’objet de mesures de protection de son habitat au niveau européen. Des inventaires sont régulièrement effectués pour connaître l’évolution de ses stations, en particulier sur les sites Natura 2000. Dans le Lot, la coordination de ces suivis est assurée par le Conservatoire Botanique National des Pyrénées et de Midi-Pyrénées. La seule station actuellement connue sur le Parc se situe au sein du site Natura 2000 « Vallées de l'Ouysse et de l'Alzou ».
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